Con el fin de garantizar el cumplimiento del PGIRHS, se establecerán mecanismos y procedimientos que permitan evaluar su estado de ejecución y realizar los ajustes pertinentes. Entre los instrumentos que permiten esta función se dispone de los Indicadores y las Auditorías de Gestión.
Para el manejo de Indicadores, deben desarrollarse registros del procesamiento de Residuos y reportes de salud ocupacional.
Las Auditorías serán internas y tienen como fin, determinar el cumplimiento de funciones, normas, protocolos de bioseguridad, programas, etc., en desarrollo del PGIRHS.